非洲科学杂志
生物技术

  • 缩写:Afr。J.生物技术公司。
  • 语言:英语
  • ISSN:1684-5315
  • 内政部:10.5897/AJB
  • 开始年份:2002年
  • 已发表文章:12368

全文研究论文

利用简单序列重复序列(SSR)标记分析埃塞俄比亚高粱(sorghum bicolor(L.)Moench)小种的遗传多样性

加马丘·奥拉尼
  • 加马丘·奥拉尼
  • 埃塞俄比亚埃亚尔梅尔卡萨农业研究中心。
  • 谷歌学者
罗非鱼热
  • 罗非鱼热
  • 埃塞俄比亚埃亚尔霍利塔农业研究中心。
  • 谷歌学者
特斯法耶·迪萨萨
  • 特斯法耶·迪萨萨
  • 埃塞俄比亚亚的斯亚贝巴大学生物技术研究所。
  • 谷歌学者


  • 收到日期:2021年9月17日
  • 接受日期:2021年11月2日
  • 出版日期:2021年11月30日

摘要

高粱[二色高粱(L.)Moench],被认为起源于埃塞俄比亚和苏丹。尽管许多形态和分子多样性研究表明高粱群体存在遗传变异,但并未考虑其在基本小种中的分布。因此,本研究旨在利用SSR标记分析埃塞俄比亚高粱地方品种的遗传变异程度和分布。埃塞俄比亚生物多样性研究所(EBI)共获得107个地方品种,代表12个生态区,根据成熟期的花序和田间穗状花序,根据种族类型进行分组。12个SSR标记共显示110个等位基因,平均多态性含量为0.76,等位基因频率显示其中42个为罕见(小于0.05),22个为0.05-0.1,46个高于0.1。预期杂合度和观察杂合度分别为0.78和0.2。群体间的遗传分化也适中(小种的FST=0.07,E/区的FST=0.13),表明它们之间基因的持续交换。总遗传变异的划分也表明,61.38%和55.17%的变异分别发生在种族和地带性群体内的个体之间。邻接聚类分析还表明,根据种族分组,地方品种有四个主要的分组,其中大多数品种Caudatam和durra形成独立的分组,而中间品种durra双色形成两个独立的子集群。在整个基因座上,种族内群体多样性显示出最大的遗传多样性(He=0.77和0.75),分别在杜拉双色种族和尾基种族中。高粱品种及其重要农艺性状的信息可用于高粱的保护和未来育种计划。

关键词:二色高粱,小种,遗传多样性,SSR。

缩写

dNTPs,脱氧核苷酸三磷酸;息税前利润,埃塞俄比亚生物多样性研究所;核电站,国家植物种质系统;照片,多态信息含量;PVP,聚乙烯吡咯烷酮;RAPD,随机扩增多态性DNA;RFLP,限制性片段长度多态性;SSR,简单序列重复。

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